RNA 或 DNA 编码链双方向对照标准遗传密码
密码子与反密码子转换器
输入 mRNA 密码子或 DNA 编码链,查看互补反密码子的两种方向写法。
输入密码子或 mRNA / DNA 序列
按 5′→3′ 输入 RNA 或 DNA 编码链。从第一个碱基开始每 3 位分组;空格、换行、逗号和分号作为分隔符忽略。
常用密码子快速查询:
5′AUG3′3′UAC5′
上:mRNA;下:tRNA 反密码子。竖线表示互补配对。
同一反密码子按 5′→3′ 书写:5′–CAU–3′
密码子与 tRNA 反密码子配对转换结果
已解析密码子数: 4
如何理解结果
密码子与反密码子
密码子是 mRNA 上的三联体,tRNA 反密码子与它反向平行配对。例如 AUG 对应 3′–UAC–5′;将同一反密码子按 5′→3′ 读取,得到 CAU。
输入链与阅读框
按 5′→3′ 输入 RNA 或 DNA 编码链,DNA 中的 T 会换成 U。第一个碱基作为第一个三联体的起点;工具不搜索起始位点、不选择阅读框。DNA 模板链须先取反向互补,转换成编码链。
为什么实际 tRNA 可能不同
本工具采用 A–U、G–C 标准互补。密码子第 3 位与反密码子 5′ 端之间的摆动配对,可能使一种 tRNA 识别多个密码子。实际识别取决于物种与碱基修饰,结果不是该物种的 tRNA 清单。上:密码子第 3 位;下:反密码子 5′ 端第 1 位。N 表示任意碱基,箭头标出摆动配对位置。
终止与起始信号
标准遗传密码中的 UAA、UAG、UGA 由释放因子识别,因此不输出普通 tRNA 反密码子。AUG 编码甲硫氨酸,是否作为翻译起点取决于上下文。本工具不处理替代遗传密码和特殊重编码。
参考:The Cell — Translation of mRNA
常见问题
Q:为什么 AUG 的答案有时是 UAC,有时是 CAU?
它们是同一互补反密码子的相反方向写法:3′–UAC–5′ = 5′–CAU–3′。书写答案时应标明方向。
Q:遇到终止密码子后会停止计算吗?
不会。工具逐一列出输入中的完整三联体并标记终止密码子,不预测实际翻译的蛋白质。