RNA 或 DNA 编码链双方向对照标准遗传密码

密码子与反密码子转换器

输入 mRNA 密码子或 DNA 编码链,查看互补反密码子的两种方向写法。

输入密码子或 mRNA / DNA 序列

按 5′→3′ 输入 RNA 或 DNA 编码链。从第一个碱基开始每 3 位分组;空格、换行、逗号和分号作为分隔符忽略。
常用密码子快速查询:
首个密码子的配对示意: AUG

上:mRNA;下:tRNA 反密码子。竖线表示互补配对。

同一反密码子按 5′→3′ 书写:5′–CAU–3′

密码子与 tRNA 反密码子配对转换结果

已解析密码子数: 4
序号mRNA 密码子 (5' → 3')tRNA 反向互补 (3' → 5')标准 tRNA 书写 (5' → 3')DNA 编码三联体 (5' → 3')对应氨基酸生物学功能
1AUGUACCAUATG
甲硫氨酸
Met / M
Met / 可作起始
2GCCCGGGGCGCC
丙氨酸
Ala / A
非极性氨基酸
3CUGGACCAGCTG
亮氨酸
Leu / L
非极性氨基酸
4UAA—(释放因子)
无反密码子
TAA
终止信号 (Stop)
Stop / *
终止

这里给出标准互补推导,不预测物种实际使用的 tRNA。起始位置取决于序列背景;本工具逐个查询三联体,不识别开放阅读框。

如何理解结果

密码子与反密码子

密码子是 mRNA 上的三联体,tRNA 反密码子与它反向平行配对。例如 AUG 对应 3′–UAC–5′;将同一反密码子按 5′→3′ 读取,得到 CAU。

输入链与阅读框

按 5′→3′ 输入 RNA 或 DNA 编码链,DNA 中的 T 会换成 U。第一个碱基作为第一个三联体的起点;工具不搜索起始位点、不选择阅读框。DNA 模板链须先取反向互补,转换成编码链。

为什么实际 tRNA 可能不同

本工具采用 A–U、G–C 标准互补。密码子第 3 位与反密码子 5′ 端之间的摆动配对,可能使一种 tRNA 识别多个密码子。实际识别取决于物种与碱基修饰,结果不是该物种的 tRNA 清单。
上:密码子第 3 位;下:反密码子 5′ 端第 1 位。N 表示任意碱基,箭头标出摆动配对位置。

终止与起始信号

标准遗传密码中的 UAA、UAG、UGA 由释放因子识别,因此不输出普通 tRNA 反密码子。AUG 编码甲硫氨酸,是否作为翻译起点取决于上下文。本工具不处理替代遗传密码和特殊重编码。

参考:The Cell — Translation of mRNA

常见问题

Q:为什么 AUG 的答案有时是 UAC,有时是 CAU?

它们是同一互补反密码子的相反方向写法:3′–UAC–5′ = 5′–CAU–3′。书写答案时应标明方向。

Q:遇到终止密码子后会停止计算吗?

不会。工具逐一列出输入中的完整三联体并标记终止密码子,不预测实际翻译的蛋白质。