終止コドンの読み方

終止コドンは、翻訳を終える位置を示すコドンです。標準遺伝暗号ではUAA、UAG、UGAが代表的な終止コドンです。

これらは通常、アミノ酸を指定しません。リボソームが正しい読み枠で終止コドンに到達すると、翻訳終結因子が働き、タンパク質合成が終了します。

終止コドンの一覧

RNA終止コドン	コード鎖DNA表記	役割
UAA	TAA	翻訳終結
UAG	TAG	翻訳終結
UGA	TGA	翻訳終結

DNA配列でTAA、TAG、TGAを見た場合、コード鎖DNAとして読んでいるなら、それぞれRNAではUAA、UAG、UGAに対応します。

終止コドンは読み枠に依存する

同じ文字列があっても、読み枠が違えば終止コドンとして読まれないことがあります。配列を3塩基ずつ区切る開始位置が変わると、下流のコドンもすべて変わります。

そのため、終止コドンを探すときは、開始コドン、読み枠、配列の向きを合わせて確認する必要があります。

途中で終止コドンが出る場合

翻訳領域の途中に終止コドンが現れると、タンパク質が短くなる可能性があります。このような変化はナンセンス変異として扱われることがあります。

ただし、注釈、読み枠、配列品質、遺伝暗号表の種類を確認せずに判断すると誤読につながります。ミトコンドリアなど一部の系では、標準遺伝暗号と異なる割り当てが使われることもあります。

配列を確認するときの手順

1. 配列がDNAかRNAかを確認する
2. コード鎖か鋳型鎖かを確認する
3. 読み枠を決める
4. UAA、UAG、UGAが正しい読み枠内にあるかを見る
5. 必要に応じて対象生物の遺伝暗号表を確認する

個別の終止コドンは、UAA、UAG、UGAの詳細ページでも確認できます。