反向互补序列计算器
支持 DNA/RNA 的反向、互补与反向互补计算,兼容 FASTA 格式输入。
反向、互补与反向互补工具
DNA/RNA序列方向转换指南
可用于引物设计、链方向检查、序列比对和ORF查找。
- 反向: 将输入序列的顺序反转。
- 互补: 按碱基配对规则生成互补链。
- 反向互补: 先反转序列,再生成互补链,用于检查DNA分子另一条链上的特征。
注意事项
- 支持格式: 支持原始DNA/RNA序列和FASTA格式,并保留FASTA标题。
- 批量序列: 可以转换多条序列,并下载为文本文件。
- 简并碱基: 支持IUPAC简并碱基,如R/Y、K/M、B/V、D/H。
- 大小写保留: 输出会保留输入中的大小写。
- 浏览器内处理: 计算在浏览器内完成,序列不会上传。
核苷酸简并代码
简并代码用于表示不确定的碱基位置。下表展示各代码的互补关系。
| Code | Nucleotides | Complement |
|---|---|---|
| A | A | T |
| G | G | C |
| C | C | G |
| T | T | A |
| U | U | A |
| R | A or G (purine) | Y |
| Y | C or T (pyrimidine) | R |
| S | C or G (strong) | S |
| W | A or T (weak) | W |
| K | G or T (keto) | M |
| M | A or C (amino) | K |
| B | C, G, or T (not A) | V |
| V | A, C, or G (not T) | B |
| D | A, G, or T (not C) | H |
| H | A, C, or T (not G) | D |
| - | gap | unchanged |
| any other | any or unknown | unchanged |
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使用方法
- 粘贴或输入 DNA/RNA 序列(支持原始序列或 FASTA)。
- 选择需要的操作:反向、互补或反向互补。
- 复制或导出结果,用于引物设计、链方向核对或注释分析。
常见问题
反向互补序列通常用在什么场景?
常用于查看另一条链上的特征、引物设计,以及处理链特异的注释与分析。
支持模糊碱基(IUPAC)吗?
支持。可处理 IUPAC 模糊碱基(例如 R↔Y、K↔M、B↔V、D↔H),并保留大小写。