標準遺伝暗号と遺伝暗号表の違い

標準遺伝暗号は、多くの生物で使われるコドンとアミノ酸の対応関係です。ただし、すべての生物や細胞内区画で完全に同じ対応が使われるわけではありません。

ミトコンドリアや一部の微生物では、特定のコドンの意味が標準遺伝暗号と異なることがあります。配列を翻訳するときは、対象生物や由来を確認して遺伝暗号表を選ぶ必要があります。

標準遺伝暗号での代表例

標準遺伝暗号では、AUGはメチオニン、UGGはトリプトファン、UAA・UAG・UGAは終止コドンです。

RNAコドン	標準遺伝暗号での意味
AUG	メチオニン、開始コドン
UGG	トリプトファン
UAA	終止
UAG	終止
UGA	終止

遺伝暗号表が違うと翻訳結果が変わる

同じDNA配列でも、使う遺伝暗号表が違えば翻訳されるアミノ酸配列が変わることがあります。特にミトコンドリア由来配列、原生生物、酵母などを扱う場合は注意が必要です。

DNAからタンパク質への変換ツールでは、標準遺伝暗号だけでなく複数の遺伝暗号表を選んで翻訳できます。

まず確認すべきこと

配列翻訳前に、次の点を確認してください。

• 配列が核ゲノム由来か、ミトコンドリア由来か
• コード鎖DNA、鋳型鎖DNA、mRNAのどれを入力しているか
• 翻訳開始位置と読み枠が合っているか
• 終止コドンが期待した位置にあるか

コドン単位の意味はコドン表で確認できます。