Sequence-analysis-tools

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配列解析ツール

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NCBI BLAST

DNA配列やタンパク質配列を貼り付けて、類似配列をNCBIデータベースから検索できます。
配列類似性検索
BLAST検索
データベース検索
Clustal Omega favicon

Clustal Omega

DNA配列、RNA配列、タンパク質配列の多重配列アライメントをブラウザ上で実行できます。
多重配列アライメント
配列比較
タンパク質配列
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MUSCLE

高速で精度の高い多重配列アライメントを行うためのWebツールです。
多重配列アライメント
配列比較
高速
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T-Coffee

一貫性スコアを使って、DNA配列やタンパク質配列の多重配列アライメントを作成します。
多重配列アライメント
配列比較
一貫性スコア
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EMBOSS Needle

Needleman-Wunsch法によるグローバルペアワイズアライメントを実行できます。
ペアワイズアライメント
グローバルアライメント
配列比較
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EMBOSS Water

Smith-Waterman法によるローカルペアワイズアライメントを実行できます。
ペアワイズアライメント
ローカルアライメント
配列比較
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ORF Finder

DNA配列からオープンリーディングフレーム(ORF)を探索できます。
ORF検索
読み枠
DNA配列解析
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Translate Tool

DNA配列を複数の読み枠でタンパク質配列へ翻訳できます。
DNA翻訳
アミノ酸配列変換
読み枠