塩基対のルール

塩基対のルールは、DNAやRNAの相補的な配列を読むための基本です。DNAではAとT、GとCが対になります。RNAではTの代わりにUを使います。

分子	塩基対
DNA	A-T、G-C
RNA	A-U、G-C
DNAとRNA	A-U、T-A、G-C、C-G

DNAの相補鎖

DNA配列が5'-ATGC-3'なら、相補鎖は3'-TACG-5'です。向きを5'から3'で書く場合は、5'-GCAT-3'になります。

この向きの違いは、プライマー設計、制限酵素サイト確認、逆相補配列の確認でよく問題になります。逆相補配列ツールを使うと、向きを含めて確認できます。

RNAではTではなくUを使う

転写後のmRNAではチミン（T）ではなくウラシル（U）を使います。コード鎖DNAがATGなら、対応するmRNAコドンはAUGです。

DNA配列をRNA表記に変えたいときは、DNAからRNAへの変換ツールを使えます。

Chargaffの規則

二本鎖DNAでは、Aの量はTの量に近く、Gの量はCの量に近くなります。これはA-T、G-Cで対になるためです。

ただし、短い配列や一本鎖配列では、AとT、GとCの数が必ず一致するとは限りません。入力している配列が一本鎖なのか二本鎖由来なのかを確認してください。

コドン表を読む前に確認すること

コドン表はmRNAコドンを基準に読むのが一般的です。DNA配列を扱っている場合は、コード鎖か鋳型鎖か、5'から3'方向かを先に確認します。

配列を直接アミノ酸へ変換したい場合は、DNAからタンパク質への変換ツールで読み枠と遺伝暗号表を指定してください。