GCAコドンとは - アラニン

GCAは標準遺伝暗号でアラニンを指定します。

コドンは、mRNAを5'から3'方向に3塩基ずつ区切って読んだ単位です。 同じ3文字でも、読み枠が1塩基ずれると以後の区切りが変わるため、タンパク質中での意味も変わります。

DNA配列を見る場合、コード鎖のGCAは転写後のRNAでGCAとして扱います。 鋳型鎖を読んでいる場合は、そのままコドンとして読まず、相補性と向きを確認してからRNA配列に直してください。

RNA表記ではGCA、コード鎖DNA表記ではGCAです。 違いはUとTだけです。RNAはウラシル（U）、DNAはチミン（T）を使います。

実験ノート、プラスミド配列、問題文ではDNA表記とRNA表記が混在しやすいため、同じ配列内では表記をそろえて確認すると誤読を減らせます。

アラニンには複数の同義コドンがあります。同義コドンは同じアミノ酸を指定しますが、生物種や遺伝子によって使われやすさが異なることがあります。

1つのコドンだけでタンパク質全体は判断できません。開始位置、読み枠、周辺のコドンを合わせて見る必要があります。 長いDNA配列やmRNA配列を読む場合は、配列翻訳ツールで全体を確認してください。

変異を調べるときは、変化前と変化後のコドンを同じ読み枠で比較します。同じアミノ酸なら同義変異、別のアミノ酸ならミスセンス変異、 終止コドンになればナンセンス変異として扱います。挿入や欠失で読み枠がずれる場合は、その位置以降を新しい読み枠で読み直します。

このページでは標準遺伝暗号を基準にしています。ミトコンドリアや一部の生物では別の遺伝暗号表を使うことがあるため、 特殊な配列を扱う場合は対象生物の遺伝暗号表も確認してください。