アミノ酸表記一覧
標準アミノ酸の一文字表記、三文字表記、正式名称、対応コドンを確認できます。
アミノ酸表記一覧:一文字表記・三文字表記・RNAコドン
| アミノ酸 | 三文字表記 | 一文字表記 | RNAコドン |
|---|---|---|---|
| アラニン | Ala | A | GCU GCC GCA GCG |
| アルギニン | Arg | R | CGU CGC CGA CGG AGA AGG |
| アスパラギン | Asn | N | AAU AAC |
| アスパラギン酸 | Asp | D | GAU GAC |
| システイン | Cys | C | UGU UGC |
| グルタミン酸 | Glu | E | GAA GAG |
| グルタミン | Gln | Q | CAA CAG |
| グリシン | Gly | G | GGU GGC GGA GGG |
| ヒスチジン | His | H | CAU CAC |
| イソロイシン | Ile | I | AUU AUC AUA |
| ロイシン | Leu | L | UUA UUG CUU CUC CUA CUG |
| リシン | Lys | K | AAA AAG |
| メチオニン | Met | M | AUG |
| フェニルアラニン | Phe | F | UUU UUC |
| プロリン | Pro | P | CCU CCC CCA CCG |
| セリン | Ser | S | UCU UCC UCA UCG AGU AGC |
| スレオニン | Thr | T | ACU ACC ACA ACG |
| トリプトファン | Trp | W | UGG |
| チロシン | Tyr | Y | UAU UAC |
| バリン | Val | V | GUU GUC GUA GUG |
アミノ酸コードとは
アミノ酸コードは、タンパク質配列を短く表すための記号です。一文字表記は配列データでよく使われ、三文字表記は教科書や構造情報で読みやすく使われます。
例えばメチオニンは一文字でM、三文字でMetと表します。DNA/RNA配列を翻訳すると、コドンごとに対応するアミノ酸コードへ変換されます。
この表では、20種類の標準アミノ酸について、一文字表記、三文字表記、対応するRNAコドンをまとめて確認できます。
一文字表記と三文字表記を使い分ける場面
一文字表記は、長いタンパク質配列をコンパクトに扱うときに便利です。FASTA配列、アラインメント、変異表記では一文字表記がよく使われます。
三文字表記は、特定の残基を読みやすく示したいときに使われます。構造生物学、酵素活性部位、変異の説明では三文字表記が理解しやすい場合があります。
どちらの表記も同じアミノ酸を指します。配列解析では、必要に応じて表記を変換しながら確認してください。
この表の使い方
アミノ酸名、三文字表記、一文字表記、RNAコドンを横に見比べて確認できます。配列中の1文字が何のアミノ酸か分からないときは、一文字表記の列を見てください。
DNA配列からタンパク質へ翻訳した結果を確認する場合は、コドン表やDNAアミノ酸変換ツールとあわせて使うと便利です。
表はコピー、CSVダウンロード、印刷に対応しているため、授業資料や実験ノートにも使えます。
アミノ酸の分類
アミノ酸は、非極性、極性、酸性、塩基性、芳香族などの性質で分類できます。これらの性質はタンパク質の折りたたみ、相互作用、機能に関係します。
例えば疎水性アミノ酸はタンパク質内部に集まりやすく、荷電アミノ酸は水溶液中や結合部位で重要になることがあります。
コードだけでなく性質も一緒に確認すると、配列の意味を理解しやすくなります。