人类密码子使用频率表
查看 人类（Homo sapiens） 的密码子使用频率、每 1,000 个密码子的出现频率、同义密码子 fraction 以及常用密码子偏好。
使用 frequency 查找该物种中最常见的密码子；使用 fraction 比较同一氨基酸家族内的同义密码子偏好。
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These settings control the summary cards and the full codon usage table below.
Top Codons by Frequency
Codons ranked by frequency per 1,000 codons in the selected organism.
GAG
Amino acid: E
Fraction 0.58
Freq 40.8
CTG
Amino acid: L
Fraction 0.41
Freq 40.3
CAG
Amino acid: Q
Fraction 0.75
Freq 34.6
AAG
Amino acid: K
Fraction 0.58
Freq 32.9
GAA
Amino acid: E
Fraction 0.42
Freq 29.0
GTG
Amino acid: V
Fraction 0.47
Freq 28.9
GCC
Amino acid: A
Fraction 0.40
Freq 28.5
GAC
Amino acid: D
Fraction 0.54
Freq 26.0
Top Codons by Fraction
Synonymous codons ranked by fraction. Stop codons and single-codon amino acids are excluded.
CAG
Amino acid: Q
Fraction 0.75
Freq 34.6
CAC
Amino acid: H
Fraction 0.59
Freq 14.9
GAG
Amino acid: E
Fraction 0.58
Freq 40.8
AAG
Amino acid: K
Fraction 0.58
Freq 32.9
TAC
Amino acid: Y
Fraction 0.57
Freq 15.6
TTC
Amino acid: F
Fraction 0.55
Freq 20.4
TGC
Amino acid: C
Fraction 0.55
Freq 12.2
GAC
Amino acid: D
Fraction 0.54
Freq 26.0
Preferred Codons by Amino Acid
One preferred codon per amino acid, ranked by frequency to surface practical defaults.
GAG
Amino acid: E
Fraction 0.58
Freq 40.8
CTG
Amino acid: L
Fraction 0.41
Freq 40.3
CAG
Amino acid: Q
Fraction 0.75
Freq 34.6
AAG
Amino acid: K
Fraction 0.58
Freq 32.9
GTG
Amino acid: V
Fraction 0.47
Freq 28.9
GCC
Amino acid: A
Fraction 0.40
Freq 28.5
GAC
Amino acid: D
Fraction 0.54
Freq 26.0
GGC
Amino acid: G
Fraction 0.34
Freq 22.8
Homo sapiens (Mamalian/HEK): (Genetic code: Standard)
Print-friendly 2-column table in genetic code order. Frequency is shown per 1,000 codons.
| Triplet | Amino acid | Fraction | Frequency/Thousand | Number | Triplet | Amino acid | Fraction | Frequency/Thousand | Number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TTT TTC TTA TTG | F F L L | 0.45 0.55 0.07 0.13 | 16.9 20.4 7.2 12.6 | 336,562 406,571 143,715 249,879 | TCT TCC TCA TCG | S S S S | 0.18 0.22 0.15 0.06 | 14.6 17.4 11.7 4.5 | 291,040 346,943 233,110 89,429 |
TAT TAC TAA TAG | Y Y * * | 0.43 0.57 0.28 0.20 | 12.0 15.6 0.7 0.5 | 239,268 310,695 14,322 10,915 | TGT TGC TGA TGG | C C * W | 0.45 0.55 0.52 1.00 | 9.9 12.2 1.3 12.8 | 197,293 243,685 25,383 255,512 |
CTT CTC CTA CTG | L L L L | 0.13 0.20 0.07 0.41 | 12.8 19.4 6.9 40.3 | 253,795 386,182 138,154 800,774 | CCT CCC CCA CCG | P P P P | 0.28 0.33 0.27 0.11 | 17.3 20.0 16.7 7.0 | 343,793 397,790 331,944 139,414 |
CAT CAC CAA CAG | H H Q Q | 0.41 0.59 0.25 0.75 | 10.4 14.9 11.8 34.6 | 207,826 297,048 234,785 688,316 | CGT CGC CGA CGG | R R R R | 0.08 0.19 0.11 0.21 | 4.7 10.9 6.3 11.9 | 93,458 217,130 126,113 235,938 |
ATT ATC ATA ATG | I I I M | 0.36 0.48 0.16 1.00 | 15.7 21.4 7.1 22.3 | 313,225 426,570 140,652 443,795 | ACT ACC ACA ACG | T T T T | 0.24 0.36 0.28 0.12 | 12.8 19.2 14.8 6.2 | 255,582 382,050 294,223 123,533 |
AAT AAC AAA AAG | N N K K | 0.46 0.54 0.42 0.58 | 16.7 19.5 24.0 32.9 | 331,714 387,148 476,554 654,280 | AGT AGC AGA AGG | S S R R | 0.15 0.24 0.20 0.20 | 11.9 19.4 11.5 11.4 | 237,404 385,113 228,151 227,281 |
GTT GTC GTA GTG | V V V V | 0.18 0.24 0.11 0.47 | 10.9 14.6 7.0 28.9 | 216,818 290,874 139,156 575,438 | GCT GCC GCA GCG | A A A A | 0.26 0.40 0.23 0.11 | 18.6 28.5 16.0 7.6 | 370,873 567,930 317,338 150,708 |
GAT GAC GAA GAG | D D E E | 0.46 0.54 0.42 0.58 | 22.3 26.0 29.0 40.8 | 443,369 517,579 577,846 810,842 | GGT GGC GGA GGG | G G G G | 0.16 0.34 0.25 0.25 | 10.8 22.8 16.3 16.4 | 215,544 453,917 325,243 326,879 |
Showing 64 entries for Homo sapiens (Mamalian/HEK).
Frequency is measured per 1,000 codons. Fraction compares codons that encode the same amino acid.
这个表适合回答的问题
在 Homo sapiens 中哪些密码子最常用？
同一氨基酸的同义密码子中，Homo sapiens 更偏好哪一个？
哪些密码子可能需要在表达设计前重点检查？
如何使用这个页面
先用摘要卡片快速找到最常用和最高 fraction 的密码子。
需要比较 frequency、fraction 或 count 时，在完整表格中切换排序。
如果要切换物种或搜索密码子/氨基酸，请使用完整的 密码子使用频率表。
常见问题
人类中最常用的密码子有哪些？
查看“最常用密码子”区域，可以按每 1,000 个密码子的出现频率判断 人类（Homo sapiens） 中哪些密码子最常见。
人类的同义密码子偏好怎么看？
查看“最高 fraction 密码子”区域，可以比较编码同一氨基酸的同义密码子中哪一个更常被使用。
codon frequency 和 fraction 有什么区别？
frequency 表示每 1,000 个密码子中的出现次数；fraction 表示该密码子在同一氨基酸的同义密码子集合中所占比例。
这个表可以直接用于密码子优化吗？
这个表适合初步查看密码子偏好，但实际表达设计还应结合宿主、载体、mRNA 结构、基因区域和实验条件综合判断。